火车路过疫区算去过吗？

不算。一般的火车在一个地方经停的时间不会太长，不会留下那个地方的行程信息。不过回去后你要如实申报问当地领导算不算？如果算你就报，不算了就不用报，在火车上，全程戴口罩，做好个人防护

中途上了中高风险城市发出的动车,算不算有中高风险城市旅居史？

这个不属于中高风险城市旅居史的，因为毕竟是在中途的，应该是只有经过了在风险区四个小时以上的，属于有旅居史。